Первичная очистка меда производится на пасеке в момент его слива из медогонки во флягу или другую емкость. Мед процеживают через фильтры, изготовленные из металлической сетки или различных тканей.

Более тонкая очистка меда производится в специальных отстойниках. Скорость отстаивания зависит от плотности меда, количества механических примесей, вязкости и его температуры. Например, метровый слой меда при температуре 10 °С отстаивается за 15 сут., при 20 °С — за 3 сут., при 30 °С — за 18 ч, при 40 °С — за 6 ч, при 50 °С — за 2 ч.